Knock out method를 통한 Synechocystics sp. PCC 6803 의 target gene function 규명
- 최초 등록일
- 2008.09.20
- 최종 저작일
- 2007.04
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소개글
Cyanobacteria인 “Synechocystics sp. PCC 6803”의 수많은 gene 중에서 우리가 원하는 X gene의 function을 찾기 위해 Knock out 방법을 시행했다.
목차
1. Introduction
Knock out method 에 관한 조사
2. Materials & Methods
3. Result
4. Discussion
5. Note
6. reference
본문내용
식물생리학(김수연 선생님)
1. Introduction
이번 실험의 최종 목적, Cyanobacteria인 “Synechocystics sp. PCC 6803”의 수많은 gene 중에서 우리가 원하는 X gene의 function을 찾기 위해 Knock out 방법을 시행했다. knock out 방법은 Reverse genetics 중 하나로써, 우리가 찾고자 하는 target gene의 기능만을 없애는 것인데, 이로 인하여 나타나는 현상을 예측해 보고, 비교 분석하여 그 gene의 기능을 알아내는 방법이다.
knock out(이하 KO) 과정에서 실행되어지는 cloning의 대해 간단히 설명을 하기 위해 KO의 전반적인 내용을 살펴보고자 한다.
(1) 원하는 유전자를 얻어낸다.
유전자를 준비한다. 유전자를 얻는 방법에는 Library screening과 PCR(Polymerase Chain Reaction) 방법이 있다. Library screening은 처음으로 어떤 유전자를 cloning할 때 쓰는 방법이며 이미 알려진 유전자의 유전정보를 이용하는 경우는 PCR을 이용한다. 우리는 후자를 이용했다.
GeneBank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html) 에서 유전자를 검색한 후, model organism으로부터 DNA를 분리한다. organisms마다 실험방법이 다르며, 또 선택된 organism의 DNA를 분리하고자 하는 부위에 따라 각기 다른 방법이 적용된다.(부위: 세포배양기에서 단층으로 자란 cell, 세포배양액 내에서 자란 cell, 혈액, 조직..)
원하는 유전자를 다량으로 얻기 위해 PCR을 실행한다. 아주 적은 양의 DNA를 이용하여 많은 양의 DNA합성이 가능하므로 분자생물학적으로 제한효소의 발견만큼 획기적인 것이라고 할 수 있다. 즉, genomic DNA와 같은 아주 큰 DNA로부터 원하는 DNA 부분만을 선택적으로 증폭시킨 후 일반적으로 사용되는 agarose gel이나 polyacrylamide gel
참고 자료
http://biochemistry.yonsei.ac.kr/biochem_molecular/gene_cloning_13.php
http://blog.naver.com/jagiya97?Redirect=Log&logNo=120003093255
http://blog.naver.com/lkh0426?Redirect=Log&logNo=100037122152
http://kin.naver.com/db/detail.php?d1id=11&dir_id=110205&eid=42eFjPzxqqEtuGoYOjtYgn6uRmu/RuaN& qb=QnJvbW9waGVub2wgYmx1ZSBkeWU=