[생물학]방사선에 손상된 DNA측정

소개글

방사선에 손상된 DNA 측정방법

목차

1. 방사선의 생물학적 효과
2. DNA염기서열변이 검출법 특성 비교
2-1. Mutant-allele-specific ampification(MASA)법
2-2. CFLP법
2-3. Invader assay법
2-4. Single strand conformation polymorphism (SSCP)법
2-5. Mut S binding assay법
2-6. Dideoxy fingerprinting(ddF)와 SSCP를 이용한 방법
2-7. Comet assay(Single cell gel electrophoresis assay;SCGE)
2-8. fluorescence in situ hybridization (FISH)
2-9. Comet assay와 FISH 조합방법
2-10. Denaturing Gradient Gel Electrophoresis(DGGE)법
2-11. ARMS법
2-12. NIRCA법
2-13. EMC법
2-14. DNA chips
2-15. DHPLC법

본문내용

방사선이 인체에 들어오면 어떠한 일들이 벌어질까? 방사선의 생물학적 효과는 입사방사선과 생물체를 구성하는 원자와의 상호작용결과 발생하는 전리현상으로 설명할 수 있으며 방사선이 궁극적으로 세포에 영향을 주는 메카니즘은 직접적 영향과 간접적 영향으로 구분된다. DNA분자의 손상은 DNA의 복제나 유전정보의 발현에 이상을 가져오기 때문에 방사선에 의한 DNA손상은 세포의 치사, 생식능력의 상실, 돌연변이 등을 유발한다. 방사선 조사에 의해 DNA에 나타나는 손상의 변화는 여러 가지로 나타난다. 즉, 한 가닥의 절단(single strand break; SSB), 두 가닥의 절단(double strand break; DSB), 염기의 손상, 염기의 손실, 분자 내 가교형성, DNA-단백질의 가교 형성 등 방사선의 에너지가 장애를 나타내는 유기물분자에 흡수되어 특정부위에 구조변화 등의 손상을 유발하는 직접작용과 세포질의 용매인 물이 이온화되고 유리기 및 과산화물을 생성하여 이러한 유리기 및 과산화물이 주변의 세포성분과 반응하여 대사 장해를 유도하는 간접자용을 들 수 있다. DNA는 염색체의 중요 구성물질이며, 염색체 이상은 방사선에 의한 생물학적 영향을 예측할 수 있는 좋은 지표가 될 수 있다.

DNA에 손상이 일어날 경우 복구(repair) 기작이 일어나게 되는데 이때 DNA 손상이 바르게 복구되지 않아 결과적으로 생기는 것이 변이이다. 다시 말하자면, 유전변이는 염기서열의 변화로 요약될 수 있다. 현미경으로 관찰이 가능한 염색체이상도 미시적으로 보면 염기서열의 변화가 수반된 DNA구조변화의 하나이다. 염기서열변화를 검출하는 방법으로는 변이가 있는 DNA 절편의 염기서열을 분석하는 방법에서부터 염기서열변화로 제한효소의 인식부위가 달라지는 것을 이용하는 Restriction fragment analysis법과 변이가 있는 부위에서 나타나는 Probe DNA와 Base pairing의 변화를 이용한 Polymerase chain reaction법이 나 Single strand로 되었을 때 DNA가 Folding되는 양상이 달라지는 것을 이용하는 Single strand conformation polymorphism분석법 등의 다양한 분석법이 개발되어 활용되고 있는데 변이검출방법을 정확도와 비용 및 변이점, 확인성 등에 관하여 구분하여 표로 정리하였다.

참고 자료

Invader assay for SNP genotyping
http://72.14.203.104/search?q=cache:mk-qYNRdhpgJ:www.biotech.umb.edu/bio697/092905.pdf+Invader+assay&hl=ko&gl=kr&ct=clnk&cd=15

Genotyping Single-Nucleotide Polymorphisms by the Invader Assay with Dual-Color Fluorescence Polarization Detection
http://www.clinchem.org/cgi/content/abstract/47/8/1373

SNP analysis of the inter-alpha-trypsin inhibitor family heavy chain-related protein (IHRP) gene by a fluorescence-adapted SSCP method
http://www.biomedcentral.com/1471-2350/3/6

Detection of polymorphisms of human DNA by gel electrophoresis as single-strand conformation polymorphisms.
http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=2565038

Protocol DGGE
http://72.14.203.104/search?q=cache:4rLUPE7N70MJ:www.nioo.knaw.nl/CL/MWE/protocol_DGGE.pdf+DGGE&hl=ko&gl=kr&ct=clnk&cd=3

NIRCA method
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=8816244&dopt=Abstract

Screening methods for detection of unknown point mutations.
http://www-users.med.cornell.edu/~jawagne/screening_for_mutations.html