[생물학실험1] 생물정보학

소개글

<생물정보학>에 대한 내용입니다.

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목차

1. 실험 제목
2. 실험 목적
3. 실험 원리(이론)
4. 실험 재료, 방법
5. 실험 결과
6. 고찰
7. 참고문헌

본문내용

1) 생물정보학[1]
- 생물학과 컴퓨터를 이용한 정보학이 통합되어 발전된 학문으로, 바이오인포매틱스라고도 한다.
- 수학이나 통계학을 기초로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 학문이다.
- 생물정보학으로 인해 유전 정보 등을 체계적으로 정리하고 발전시킬 수 있었으며, 컴퓨터를 이용한 실험 모델의 생산 등이 가능해졌다.

2) NCBI [2]
- 미국 국립생물공학정보센터
- 생물 의학 및 게놈 정보에 대한 액세스를 제공함으로써 과학과 건강을 발전시키는 정보센터
- 게놈 분석, 서열 비교, 서열 검색 방법론, 고분자 구조 등을 포함하여 분자 생물학 및 유전학의 계산, 수학 및 이론적 문제에 대한 기본 및 응용 연구를 수행한다.

3) BLAST [3]
- Basic Local Alignment Search Tool 의 약자
- 생물학적 서열 간의 유사성 영역을 찾으며, 뉴클레오타이드 또는 단백질 서열을 서열 데이터베이스와 비교하고 통계적 유의성을 계산할 수 있다. 이를 통해 각 서열의 생물학적 출처를 알 수 있다.
- SEED : 데이터베이스의 모든 단어들이 모여있는 사전 역할을 한다.
- EXTEND : 각 일치하는 단어를 정렬하는 절차를 실행한다.
- REPROT : 임계값을 초과할 때의 정렬을 유지한다.
- Blastn : 핵산(DNA) 서열을 DNA 데이터베이스로부터 찾고자 할 때 사용한다.
Blastp : 단백질 서열을 단백질 데이터베이스로부터 찾고자 할 때 사용한다.

4) BLOSUM [4]
- Blocks Substitution Matrix 의 약자
- 아미노산 서열을 정렬할 때, BLOSUM이 사용된다.
- 단백질 서열들 간 서열 유사도를 비교, 분석할 수 있다.
- BLOSUM의 점수행렬에서 양수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수 있는 경우를 나타내며, 음수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀌지 않는 경우를 나타낸다.
- BLOSUM의 점수가 높을수록 서열의 유사도가 높다는 것을 나타낸다.

참고 자료

생물정보학. 과학문화포털 사이언스올. 생물 정보학(bioinformatics) | 과학문화포털 사이언스올 (scienceall.com)
NCBI. National Center for Biotechnology Information (nih.gov)
BLAST. NCBI. BLAST: Basic Local Alignment Search Tool (nih.gov)
BLOSUM. Bioinformatics Tools FAQ - Job Dispatcher Sequence Analysis Tools - EMBL-EBI
Multiple sequence alignment. Bioinformatics Tools FAQ - Job Dispatcher Sequence Analysis Tools - EMBL-EBI