아주대학교 A+ 생명과학실험 생물정보학실습

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목차

1.실험목적
2.실험이론
3.실험방법
4.실험결과
5.고찰
6.참고문헌

본문내용

[1] 실험목적
생물 정보학 Tool을 사용하는 법을 배워 알 수 없는 유전자 샘플을 데이터베이스와 대조해 어떤 서열인지 찾아낸다. 또, 이 Tool을 이용해 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해보고 DNA 및 단백질 서열 기반 생물 계통수를 그려본다.
[2] 실험이론
생물정보학은 수학이나 통계학을 기초로 하여 컴퓨터를 이용해 생물학을 연구하는 학문을 통틀어 의미한다. BLAST는 DNA 염기 서열과 아미노산 서열 등과 같이 생물학적 서열 정보를 비교하는 알고리즘으로 특정 서열을 BLAST의 데이터베이스와 비교하여 동정할 수 있다. BLOSUM은 서열을 정렬할 때 쓰이는 치환 행렬로 두 아미노산 간의 유사성을 나타내는 매트릭스이다. BLOSUM을 이용하면 단백질 서열 간의 유사도를 비교 분석할 수 있다. score가 높을수록 상동 일치 관계(homology)가 더 있다고 볼 수 있다.

참고 자료

위키피디아, BLOSUM, https://ko.wikipedia.org/wiki/BLOSUM
위키피디아, 다중서열정렬, https://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%8B%A4%EC%A4%91%EC%84%9C%EC%97%B4%EC%A0%95%EB%A0%AC
지식백과, 다중서열정렬, https://terms.naver.com/entry.naver?docId=5703226&cid=61232&categoryId=61232
지식백과, 유연관계, https://terms.naver.com/entry.naver?docId=5772931&cid=40942&categoryId=32324