Primer design_일반생물학및실험1

목차

1. Title
2. Date
3. Name
4. Purpose
5. Materials
6. Methods
7. Results
8. Discussion
9. Projects
10. Reference

본문내용

1. Title : Polymerase chain reaction(PCR)을 위한 primer 제작

4. Purpose : 원하는 gene에서의 PCR을 시행하기에 앞서 그에 맞는 primer를 제작할 수 있다.

5. Materials : gene database.

6. Methods
< Primer design시 유의사항 >
① 길이는 20~30bp가 적당하다.
② G+C%가 50~60%로 구성되며 purine과 pyrimidine 염기의 연속적인 배열을 피한다.
③ 한 쌍의 primer가 부분적으로 서로 상보적이지 않아야 한다.
④ Primer의 3’말단에는 T가 오도록 하지 않는다.
T는 자신과 상보적인 nucleotide를 감별하는 능력이 부족하다
⑤ Primer의 3’말단에 G or C 가 3개 이상 연속적으로 오지 않도록 하여 hairpin loop 형 성을 피한다.
⑥ Tm값이 비슷한 두 primer를 설계한다.
Tm value = [4*(G+C) + 2*(A+T)]
Annealing temperature = Tm - 3도

9. Project
① Restriction enzyme (blunt end, sticky end 포함)에 대해 조사하시오
② ORF (open reading frame)에 대해 조사하시오

참고 자료

[위키피디아] Primer (molecular biology)
[위키피디아] Primer dimer
[네이버 지식백과] 판코니빈혈 [Fanconi’s anaemia], 희귀질환정보, 질병관리본부 희귀질환헬프라인
[네이버 지식백과] 헤어핀 구조 [hairpin loop], 생화학백과, 생화학분자생물학회
[네이버 지식백과] PCR법 [polymerase chain reaction], 두산백과
[네이버 지식백과] 개방형 해독틀 [ openreadingframe , ORF ], 식품과학기술대사전, 2008
[네이버 지식백과] 제한효소 [Restriction enzyme], 두산백과
[네이버 지식백과] 어닐링 [annealing], 화학용어사전, 화학용어사전편찬회, 윤창주, 2011
[네이버 지식백과] 수소결합, 화학백과, 대한화학회
[네이버 지식백과] 두가닥말단 [ bluntend , ~末端 ], 생명과학대사전, 강영희, 2014
[네이버 지식백과] 접착성 말단[ 接着性末端 , sticky end ], 화학용어사전, 화학용어사전 편찬회, 2011