목차
I. Introduction
1. 단백질
2. MALDI-TOF 질량분석법
II. Methods and Materials
1. 실험기구 및 시약
2. 실험 과정
III. Data and Results
1. Protein Identification - A
2. Protein Identification - B
3. Protein Identification - C
4. Protein Identification - D
IV. Discussion
1. Peak의 m값과 펩타이드 서열의 분자량의 차이 분석
2. 동정하지 못한 peak 분석
본문내용
1. 단백질
단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이다. 펩타이드(peptide)란 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것으로, 한 쪽 아미노산의 아미노기와 다른 쪽 카복실기로 구성된다. 중심 탄소 원자는 이외에도 수소 하나와 R기(R-group)이 결합되어 있으며, 이 R기가 아미노산의 종류를 특정한다. 펩타이드를 형성하는데 사용된 단량체를 각각 잔기(residue)라고 하며, 이 잔기들이 백 개 이상정도 결합한 고분자를 폴리펩타이드(polypeptide)라고 부른다. 이 사슬에 잔기들이 배열되어 있는 순서를 일차 구조, 사슬 자체가 형성하는 구조를 이차 구조, 사슬들이 접히며 만들어지는 삼차원 형태를 삼차 구조, 폴리펩타이드들이 모여 형성하는 또 다른 모양을 사차 구조라고 한다.
2. MALDI-TOF 질량분석법
물질의 몰질량을 측정하는 기존의 방법은 시료를 기체상 이온으로 바꾸어 각 이온들의 질량/전하수 값을 측정하는 질량 분석법이다. 그러나 단백질과 같은 고분자의 경우, 큰 분자를 작게 나누지 않고서 고분자의 기체상 이온을 만들기가 어려워, 기반-이용 레이저 탈착/이온화 법(MALDI, Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization)이 개발되었다. 이 MALDI법과 비행 시간(TOF, Time Of Flight) 이온 검출기를 결합시킨 질량 분석법을 MALDI-TOF라고 한다.
분석 물질에 자외선을 흡수하는 역할을 하는 matrix를 넣어주고 레이저로 적외선 또는 자외선을 쪼여주면, matrix가 기화되어 분석 물질을 포함한 상태로 기체상으로 확산된다. 분석 물질 사이의 결합이 억제되면서 이 기체상 시료는 전하를 띠는 이온이 되고, 여기에 전압을 걸어주면 이온들이 분석계 안으로 들어가게 된다. 전기 퍼텐셜 차이에 의해 초반 거리 d에 걸쳐 가속된 이온들은 길이가 l인 표류 영역을 통과하며..
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참고 자료
Atkins, Jones, and Laverman, 『화학의 원리 7판』, 김관 외, 자유아카데미, 2018.
Atkins and Paula, 안운선, 『물리화학 10판』, 교보문고, 2017.
Harris, Daniel C. 『분석화학 9판』, 강용철 외, 자유아카데미, 2017.
Hillis, Sadava, Heller and price, Principles of life, VA: W. H. Freeman and Company, 2012,
김희준, 『일반화학실험』, 자유아카데미, 2010.